Описание курса
В рамках курса слушатели изучат способы пробоподготовки растительного материала для проточной цитометрии, установят плоидность и размер генома растений, ознакомятся с гибридизационными процессами. Участники курса узнают об основных программных обеспечениях для работы с нуклеотидными последовательностями и ознакомятся с принципами работы.
Правообладатель
ФГБОУ ВО «Алтайский государственный университет»
Содержание курса
- Теория анализа плоидности и содержания ДНК растений.
- Подходы в пробоподготовке и проблемы стандартизации.
- Практикум. Цитофлюориметрия растений. Пробоподготовка и интерпретация данных. Анализ результатов.
- Молекулярная эволюция. Получение молекулярно-генетических данных, генбанки.
- Проведение анализа (выделение ДНК, ПЦР, секвенирование).
- Практическое применение молекулярно-генетического анализа.
- Обработка молекулярно-филогенетических данных.
- Статистический анализ количественных морфологических признаков.
- Практикум. Филогенетическое исследование. Статистическая обработка морфологических измерений.
Требования
Высшее образование.
Результаты обучения
Знать:
- основы метода проточной цитофлюориметрии, обработки и интерпретации данных;
- методы выделения и окрашивания ядер растений;
- ICM определение размера геномов;
- основы изучения молекулярной филогении, обработки и интерпретации данных: секвенирование целевых последовательностей ДНК, выравнивание, поиск моделей нуклеотидных замен, построение филогенетических деревьев и филогенетических сетей;
- основы функциональной транскриптомики поиск (получение) первичных ДЭГов, построение сетей белок-белковых взаимодействий и аннотация полученных сетей.
- основы статистического анализа морфологических данных: планирование эксперимента, проверка нормальности данных, статистические тесты, методы сокращения размерности данных с целью определения вклада изучаемых характеристик в общую дисперсию данных.
Уметь:
- анализировать данные цитометрии, составлять протоколы цитометрии, селектировать позитивные и негативные события в процессе анализа данных флуоресценции, подбирать образцы для измерения содержания ДНК растений и видов естественной флоры;
- анализировать полученные данные реконструкции филогенетических взаимоотношений, выделять операционные таксономические единицы в группы;
- анализировать полученные сети белок-белковых взаимодействий с целью определения функционального ответа организма в ответ на стресс;
- анализировать результаты статистических тестов и сокращение размерности данных с целью выявления наиболее важных для классификации морфологических признаков.
Владеть:
- методами пробоподготовки, выделения ядер, статистической обработки данных цитометрии;
- методами реконструкции филогенетических взаимоотношений;
- методами определения ДЭГов, построение сетей белок-белковых взаимодействий и аннотации этих сетей;
- методами статистической обработки морфологических данных
Компетенции
СК-1: способен оперировать основными биологическими понятиями, знаниями биологических явлений, закономерностей, законов, теорий и гипотез;
СК-4: способен ориентироваться в вопросах биохимического единства органического мира, молекулярных основах наследственности, изменчивости и методах генетического анализа;
СК-7: готов применять биологические и экологические знания для анализа прикладных проблем хозяйственной деятельности;
СК-8: готов к самостоятельному проведению исследований, постановке естественнонаучного эксперимента, использованию информационных технологий для решения научных и профессиональных задач, анализу и оценке результатов лабораторных и полевых исследований.
Рекомендуемые направления подготовки
06.04.01 Биология
19.04.01 Биотехнология