Course Description

В рамках курса слушатели изучат способы пробоподготовки растительного материала для проточной цитометрии, установят плоидность и размер генома растений, ознакомятся с гибридизационными процессами. Участники курса узнают об основных программных обеспечениях для работы с нуклеотидынми последовательностями и ознакомятся с принципами работы.

Программа ДПО предназначена для биологов, научных сотрудников, научно-педагогических работников, специалистов в области селекции растений, студентов, магистрантов, аспирантов.

Авторы курса: 

  • Куцев М.Г. к.б.н., специалст в области молекулярной генетики растений.
  • Скапцов М.В. к.б.н., специалист в области проточной цитометрии растений.
  • Путилин И.Р. м.н.с., специалист в области статистической обработки биологических данных. 
  • Уварова О.В. к.б.н.
  • Колтунова А.М. м.н.с.
  • Зайков В.Ф., м.н.с
  • Панкратов С.Ю., м.н.с.

Формат курса: программа ДПО

Уровень образования: бакалавриат.

Длительность обучения: 72 часа.

В результате обучения слушатели получат знания в области протчной цитометрии и навыки обработки статистических данных с помощью программы R-stidio.

Copyright holder
ФГБОУ ВО «Алтайский государственный университет»

Course content

  1. Теория анализа плоидности и содержания ДНК растений.
  2. Подходы в пробоподготовке и проблемы стандартизации.
  3. Практикум. Цитофлюориметрия растений. Пробоподготовка и интерпретация данных. Анализ результатов.
  4. Молекулярная эволюция. Получение молекулярно-генетических данных, генбанки.
  5. Проведение анализа (выделение ДНК, ПЦР, секвенирование).
  6. Практическое применение молекулярно-генетического анализа.
  7. Обработка молекулярно-филогенетических данных.
  8. Статистический анализ количественных морфологических признаков.
  9. Практикум. Филогенетическое исследование. Статистическая обработка морфологических измерений.

Requirements

Высшее образование.

Learning outcomes

Знать:

- основы метода проточной цитофлюориметрии, обработки и интерпретации данных;

- методы выделения и окрашивания ядер растений;

- ICM определение размера геномов;

- основы изучения молекулярной филогении, обработки и интерпретации данных: секвенирование целевых последовательностей ДНК, выравнивание, поиск моделей нуклеотидных замен, построение филогенетических деревьев и филогенетических сетей;

- основы функциональной транскриптомики поиск (получение) первичных ДЭГов, построение сетей белок-белковых взаимодействий и аннотация полученных сетей.

- основы статистического анализа морфологических данных: планирование эксперимента, проверка нормальности данных, статистические тесты, методы сокращения размерности данных с целью определения вклада изучаемых характеристик в общую дисперсию данных.

Уметь:

- анализировать данные цитометрии, составлять протоколы цитометрии, селектировать позитивные и негативные события в процессе анализа данных флуоресценции, подбирать образцы для измерения содержания ДНК растений и видов естественной флоры;

- анализировать полученные данные реконструкции филогенетических взаимоотношений, выделять операционные таксономические единицы в группы;

- анализировать полученные сети белок-белковых взаимодействий с целью определения функционального ответа организма в ответ на стресс;

- анализировать результаты статистических тестов и сокращение размерности данных с целью выявления наиболее важных для классификации морфологических признаков.

Владеть:

- методами пробоподготовки, выделения ядер, статистической обработки данных цитометрии;

- методами реконструкции филогенетических взаимоотношений;

- методами определения ДЭГов, построение сетей белок-белковых взаимодействий и аннотации этих сетей;

- методами статистической обработки морфологических данных

Competencies

– способен оперировать основными биологическими понятиями, знаниями биологических явлений, закономерностей, законов, теорий и гипотез (СК-1);

– способен ориентироваться в вопросах биохимического единства органического мира, молекулярных основах наследственности, изменчивости и методах генетического анализа (СК-4);

– готов применять биологические и экологические знания для анализа прикладных проблем хозяйственной деятельности (СК-7);

– готов к самостоятельному проведению исследований, постановке естественнонаучного эксперимента, использованию информационных технологий для решения научных и профессиональных задач, анализу и оценке результатов лабораторных и полевых исследований (СК-8).

Recommended areas of training
06.04.01
19.04.01

Course start date: 03-03-2025 Duration (weeks): 4 Ability to get a certificate: No Labor intensity of the course in z. e: 2

The teachers of the course