Course Description
В рамках курса слушатели изучат способы пробоподготовки растительного материала для проточной цитометрии, установят плоидность и размер генома растений, ознакомятся с гибридизационными процессами. Участники курса узнают об основных программных обеспечениях для работы с нуклеотидынми последовательностями и ознакомятся с принципами работы.
Программа ДПО предназначена для биологов, научных сотрудников, научно-педагогических работников, специалистов в области селекции растений, студентов, магистрантов, аспирантов.
Авторы курса:
- Куцев М.Г. к.б.н., специалст в области молекулярной генетики растений.
- Скапцов М.В. к.б.н., специалист в области проточной цитометрии растений.
- Путилин И.Р. м.н.с., специалист в области статистической обработки биологических данных.
- Уварова О.В. к.б.н.
- Колтунова А.М. м.н.с.
- Зайков В.Ф., м.н.с
- Панкратов С.Ю., м.н.с.
Формат курса: программа ДПО
Уровень образования: бакалавриат.
Длительность обучения: 72 часа.
В результате обучения слушатели получат знания в области протчной цитометрии и навыки обработки статистических данных с помощью программы R-stidio.
Copyright holder
ФГБОУ ВО «Алтайский государственный университет»
Course content
- Теория анализа плоидности и содержания ДНК растений.
- Подходы в пробоподготовке и проблемы стандартизации.
- Практикум. Цитофлюориметрия растений. Пробоподготовка и интерпретация данных. Анализ результатов.
- Молекулярная эволюция. Получение молекулярно-генетических данных, генбанки.
- Проведение анализа (выделение ДНК, ПЦР, секвенирование).
- Практическое применение молекулярно-генетического анализа.
- Обработка молекулярно-филогенетических данных.
- Статистический анализ количественных морфологических признаков.
- Практикум. Филогенетическое исследование. Статистическая обработка морфологических измерений.
Requirements
Высшее образование.
Learning outcomes
Знать:
- основы метода проточной цитофлюориметрии, обработки и интерпретации данных;
- методы выделения и окрашивания ядер растений;
- ICM определение размера геномов;
- основы изучения молекулярной филогении, обработки и интерпретации данных: секвенирование целевых последовательностей ДНК, выравнивание, поиск моделей нуклеотидных замен, построение филогенетических деревьев и филогенетических сетей;
- основы функциональной транскриптомики поиск (получение) первичных ДЭГов, построение сетей белок-белковых взаимодействий и аннотация полученных сетей.
- основы статистического анализа морфологических данных: планирование эксперимента, проверка нормальности данных, статистические тесты, методы сокращения размерности данных с целью определения вклада изучаемых характеристик в общую дисперсию данных.
Уметь:
- анализировать данные цитометрии, составлять протоколы цитометрии, селектировать позитивные и негативные события в процессе анализа данных флуоресценции, подбирать образцы для измерения содержания ДНК растений и видов естественной флоры;
- анализировать полученные данные реконструкции филогенетических взаимоотношений, выделять операционные таксономические единицы в группы;
- анализировать полученные сети белок-белковых взаимодействий с целью определения функционального ответа организма в ответ на стресс;
- анализировать результаты статистических тестов и сокращение размерности данных с целью выявления наиболее важных для классификации морфологических признаков.
Владеть:
- методами пробоподготовки, выделения ядер, статистической обработки данных цитометрии;
- методами реконструкции филогенетических взаимоотношений;
- методами определения ДЭГов, построение сетей белок-белковых взаимодействий и аннотации этих сетей;
- методами статистической обработки морфологических данных
Competencies
– способен оперировать основными биологическими понятиями, знаниями биологических явлений, закономерностей, законов, теорий и гипотез (СК-1);
– способен ориентироваться в вопросах биохимического единства органического мира, молекулярных основах наследственности, изменчивости и методах генетического анализа (СК-4);
– готов применять биологические и экологические знания для анализа прикладных проблем хозяйственной деятельности (СК-7);
– готов к самостоятельному проведению исследований, постановке естественнонаучного эксперимента, использованию информационных технологий для решения научных и профессиональных задач, анализу и оценке результатов лабораторных и полевых исследований (СК-8).
Recommended areas of training
06.04.01
19.04.01